Für das Hosting seiner Website setzt Aquarium Münster ab sofort auf grünes Hosting des Unternehmens Estugo. Die Firma nutzt ausschließlich Energie aus erneuerbaren Quellen und setzt nach Angaben von Aquarium Münster nur Hardware von Markenherstellern ein, die nachweislich energieeffizient arbeiten. Die Server befinden sich dabei in Deutschland. Aquarium Münster bemüht sich nach eigenen Angaben ebenfalls um eine ressourcenschonende Produktion und Abfallvermeidung. Der Bedarf des Unternehmens an Elektrizität wird ausschließlich durch erneuerbare Energien gedeckt.